新客站建成后,火车东站以停靠通过列车为主,始发列车均从新客站发车。杭州和上海南站间每天有5列空调旅游列车往返,行程177公里,票价仅需25元。
杭州火车新客站分为地下、地面、高架三层,地下是专供出租车、自备车接客的停车场,出租车和自备车各有150个泊位。地面由大厅和广场组成,是大客车和行人接客场所。
大厅的南北侧都是公交车的始发站点,其中北侧分别为11路、21路、518路公交车;南侧分别为7路、39路、3路公交车;北面的回车道(红楼饭店前)分别为555路、156路、151路公交车。